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基因鑒定技術在擬釘螺亞科物種鑒定中的應用進展

時間:2018-07-19 10:54:41 來源:我要考公務員網 本文已影響

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  [摘要]擬釘螺亞科內物種是多種并殖吸蟲及亞洲組血吸蟲的中間宿主,對其進行準確的分類鑒定對防控相關寄生蟲病有重要作用。然而受限于個體小、形態特征不明顯等問題,傳統方法難以對擬釘螺亞科內物種作出準確的鑒定。隨著近年分子生物學及生物信息學相關技術的高速發展,基因鑒定法變得日趨成熟,這使得快速、準確的鑒定擬釘螺亞科物種成為了可能。本文回顧了近年來基因鑒定法中常用的基因片段及其在擬釘螺亞科分類鑒定方面的應用情況,討論了目前應用中存在的問題并提出了未來進一步的研究方向。
  [關鍵詞]擬釘螺亞科;物種鑒定;基因鑒定;寄生蟲病
  [中圖分類號] R383.2 [文獻標識碼] A [文章編號] 1674-4721(2016)12(a)-0011-04
  Application progress of gene identification technology in species identification of Triculinae
  QIU Min1 CHEN Qing1 KE Xue-mei2
  1.Department of Public Health,Southern Medical University in Guangdong Province,Guangzhou 510515,China;2.Xiamen Center for Disease Control and Prevention in Fujian Province,Xiamen 361021,China
  [Abstract]Triculinae is known to be the intermediate host of Paragonimus and Asian Schistosomes,and the accuracy of identification result of Triculinae is essential for the control of parasitic diseases caused by Paragonimus and Asian Schistosomes.Due to its small size and lack of significant appearance feature,it′s hard to identify Triculinae accurately.With the development of molecular biology and bioinformatics,it is possible to identify Triculinae species using genetic m

基因鑒定技術在擬釘螺亞科物種鑒定中的應用進展

ethod now.This paper reviews gene segements frequenctly used in species identification and their application to Triculinae identification,and discusses the obstacle for further use.
  [Key words]Triculinae;Species identification;Genetic method;Parasitic diseases
  擬釘螺亞科(Triculinae)隸屬于腹足綱(Gastropoda)前鰓亞綱(Prosobranch)圓口螺科(Pomatiopsidae),主要分布于東南亞和中國南部[1]。目前該亞科內的物種已達120種[2],我國目前發現的擬釘螺亞科物種已有近50種之多,其中絕大多數屬于擬釘螺屬,主要分布在長江流域地區及其以南的地區。在所有擬釘螺物種中,擬釘螺屬(Tricula)、γ擬釘螺屬(Gammatricula)以及新擬釘螺屬(Neotricula)因可做為多種并殖吸蟲[3-7]和(或)亞洲組血吸蟲[8-10]的中間宿主而備受研究者關注。然而,擬釘螺作為一種個體微小的淡水螺,很難依據其外殼及唇舌等形態學特征對其作出較為準確的分類,為傳染病防控工作者對相關的寄生蟲病的宿主監測及防控工作帶來了巨大的困難。
  近20年來,分子生物學技術和生物信息學技術得到了長足的發展,獲得生物體的遺傳物質并測定基因序列,進而對序列進行比較分析變得越來越簡便易行,這為從分子水平研究物種的分類提供了充分的技術可能[11]。因此,結合了兩者的分子系統發生學得到了高速的發展,越來越多的學者開始使用系統發生學的研究方法檢驗分類學假說并獲得更可靠的分類結果[12-15]。而由此誕生的龐大生物遺傳信息數據庫,又為物種的快速鑒定提供了可能。本文擬對相關技術在擬釘螺亞科物種鑒定上的應用情況作一綜述,希望通過總結目前相關技術的應用情況發現目前存在的問題以理清當前的工作要點,更好地將技術應用于實踐。
  1常見的鑒定用基因
  1.1 COⅠ基因
  COⅠ基因全稱Cytochrome C oxidase subunit Ⅰ gene,其位于生物線粒體基因組上,是編碼細胞色素C氧化酶亞單位1的基因。與核基因組比較,其具有高拷貝,進化速率較快、群體內變異大、無組織特異性等特點[16]。COⅠ基因并不是最早被應用于分子鑒定的基因,但其在各種動物鑒定中應用己相當廣泛。加拿大奎爾夫大學的Hebert等[17]最早于2003年提出了DNA條碼(DNA Barcode)的概念,其認為在數據庫完備的情況下,基于COI基因的比對分析可快速準確地鑒定出DNA來源的物種,因此COI可以作為理想的動物DNA條碼應用于實際的動物物種鑒定工作中。在其后的幾年中,各國學者對COI基因鑒定動物物種的可能性進行了進一步的研究[18-20],并成立了國際生物條碼計劃(the internnational barcode of life project,iBOL)、生物條碼協會(the consortium for barcode of life,CBOL)以及生物條碼數據庫(barcode of life database,BOLD)。目前,BOLD中已經收集了包括動物、植物、真菌以及單細胞生物中共計260 135個物種的DNA條碼[21],其收錄內容已不限于初創時的COI基因,亦涵蓋其他常見的鑒定用基因,適應不同種類物種的鑒定需求。同時,該數據庫還同時收錄標準的PCR擴增引物,以供研究者參考選用。
 
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    教案 日期:2018-06-23

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    教案 日期:2018-06-23

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    教案 日期:2018-06-26

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    句子 日期:2018-07-19

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    句子 日期:2018-07-19

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    句子 日期:2018-07-19

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